Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja3Q64448 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gja3Q64448 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms