Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ca4Q64444 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ca4Q64444 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ca4Q64444 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ca4Q64444 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ca4Q64444 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ca4Q64444 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ca4Q64444 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ca4Q64444 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ca4Q64444 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ca4Q64444 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ca4Q64444 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ca4Q64444 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ca4Q64444 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ca4Q64444 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ca4Q64444 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ca4Q64444 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ca4Q64444 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ca4Q64444 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ca4Q64444 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ca4Q64444 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ca4Q64444 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ca4Q64444 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ca4Q64444 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ca4Q64444 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ca4Q64444 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ca4Q64444 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ca4Q64444 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ca4Q64444 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ca4Q64444 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ca4Q64444 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ca4Q64444 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ca4Q64444 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ca4Q64444 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ca4Q64444 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ca4Q64444 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ca4Q64444 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ca4Q64444 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ca4Q64444 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ca4Q64444 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms