Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms