Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Itga3Q62470 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms