Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Taf6Q62311 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms