Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Ddx3xQ62167 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Ddx3xQ62167 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Ddx3xQ62167 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Ddx3xQ62167 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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Ddx3xQ62167 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Ddx3xQ62167 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Ddx3xQ62167 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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Ddx3xQ62167 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx3xQ62167 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx3xQ62167 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms