Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrn1Q61809 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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