Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lama3Q61789 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms