Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifna11Q61716 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifna11Q61716 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna11Q61716 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna11Q61716 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna11Q61716 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna11Q61716 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna11Q61716 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna11Q61716 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna11Q61716 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna11Q61716 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna11Q61716 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna11Q61716 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna11Q61716 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna11Q61716 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna11Q61716 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna11Q61716 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna11Q61716 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna11Q61716 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna11Q61716 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna11Q61716 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna11Q61716 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna11Q61716 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna11Q61716 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms