Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifi47Q61635 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifi47Q61635 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifi47Q61635 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifi47Q61635 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifi47Q61635 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifi47Q61635 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifi47Q61635 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifi47Q61635 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifi47Q61635 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifi47Q61635 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifi47Q61635 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifi47Q61635 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifi47Q61635 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifi47Q61635 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifi47Q61635 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifi47Q61635 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifi47Q61635 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifi47Q61635 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifi47Q61635 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifi47Q61635 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifi47Q61635 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ifi47Q61635 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 368.9 ms