Protein–RNA interactions for Protein: Q61526

Erbb3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb3Q61526 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Erbb3Q61526 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Erbb3Q61526 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Erbb3Q61526 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Erbb3Q61526 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Erbb3Q61526 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Erbb3Q61526 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Erbb3Q61526 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Erbb3Q61526 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Erbb3Q61526 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Erbb3Q61526 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Erbb3Q61526 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Erbb3Q61526 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Erbb3Q61526 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Erbb3Q61526 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Erbb3Q61526 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Erbb3Q61526 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms