Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BcanQ61361 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BcanQ61361 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BcanQ61361 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BcanQ61361 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BcanQ61361 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BcanQ61361 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BcanQ61361 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BcanQ61361 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BcanQ61361 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BcanQ61361 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms