Protein–RNA interactions for Protein: Q61316

Hspa4, Heat shock 70 kDa protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspa4Q61316 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hspa4Q61316 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hspa4Q61316 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms