Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tfap2bQ61313 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms