Protein–RNA interactions for Protein: Q61206

Pafah1b2, Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah1b2Q61206 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b2Q61206 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b2Q61206 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b2Q61206 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b2Q61206 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b2Q61206 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b2Q61206 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b2Q61206 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pafah1b2Q61206 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pafah1b2Q61206 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pafah1b2Q61206 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pafah1b2Q61206 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pafah1b2Q61206 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pafah1b2Q61206 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pafah1b2Q61206 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pafah1b2Q61206 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pafah1b2Q61206 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pafah1b2Q61206 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pafah1b2Q61206 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms