Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna1Q60960 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna1Q60960 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna1Q60960 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna1Q60960 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna1Q60960 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna1Q60960 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kpna1Q60960 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kpna1Q60960 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kpna1Q60960 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kpna1Q60960 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kpna1Q60960 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kpna1Q60960 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Kpna1Q60960 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kpna1Q60960 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms