Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grik1Q60934 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms