Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Klf4Q60793 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klf4Q60793 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms