Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mkrn3Q60764 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms