Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tcf4Q60722 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcf4Q60722 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tcf4Q60722 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tcf4Q60722 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcf4Q60722 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms