Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Samhd1Q60710 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms