Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Foxd4Q60688 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms