Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnf123Q5XPI3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms