Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc5a6Q5U4D8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms