Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scaf1Q5U4C3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms