Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdcp1Q5U462 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms