Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PfasQ5SUR0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PfasQ5SUR0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms