Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctc1Q5SUQ9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms