Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Utp18Q5SSI6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms