Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQX6

Cyfip2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip2Q5SQX6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cyfip2Q5SQX6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyfip2Q5SQX6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cyfip2Q5SQX6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cyfip2Q5SQX6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cyfip2Q5SQX6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cyfip2Q5SQX6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cyfip2Q5SQX6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cyfip2Q5SQX6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyfip2Q5SQX6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyfip2Q5SQX6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyfip2Q5SQX6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyfip2Q5SQX6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyfip2Q5SQX6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyfip2Q5SQX6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 262.5 ms