Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bhlha9Q5RJB0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms