Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q5EBG8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q5EBG8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q5EBG8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q5EBG8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q5EBG8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q5EBG8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q5EBG8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms