Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Nlrc3Q5DU56 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Nlrc3Q5DU56 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nlrc3Q5DU56 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrc3Q5DU56 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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