Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Eme2Q56A04 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Eme2Q56A04 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Eme2Q56A04 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Eme2Q56A04 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Eme2Q56A04 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Eme2Q56A04 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Eme2Q56A04 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Eme2Q56A04 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Eme2Q56A04 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Eme2Q56A04 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Eme2Q56A04 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Eme2Q56A04 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Eme2Q56A04 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Eme2Q56A04 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Eme2Q56A04 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eme2Q56A04 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eme2Q56A04 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eme2Q56A04 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eme2Q56A04 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eme2Q56A04 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eme2Q56A04 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eme2Q56A04 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eme2Q56A04 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eme2Q56A04 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eme2Q56A04 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eme2Q56A04 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eme2Q56A04 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eme2Q56A04 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eme2Q56A04 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eme2Q56A04 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eme2Q56A04 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eme2Q56A04 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eme2Q56A04 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eme2Q56A04 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eme2Q56A04 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eme2Q56A04 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eme2Q56A04 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms