Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srrm1Q52KI8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srrm1Q52KI8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srrm1Q52KI8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srrm1Q52KI8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srrm1Q52KI8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Srrm1Q52KI8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srrm1Q52KI8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srrm1Q52KI8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srrm1Q52KI8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srrm1Q52KI8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srrm1Q52KI8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srrm1Q52KI8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srrm1Q52KI8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srrm1Q52KI8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srrm1Q52KI8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srrm1Q52KI8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srrm1Q52KI8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms