Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms