Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN81

H2-Q2, Histocompatibility 2, Q region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q2Q4KN81 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2-Q2Q4KN81 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-Q2Q4KN81 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.32■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.28■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.28■■□□□ 1
H2-Q2Q4KN81 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms