Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL18

Tmem171, Transmembrane protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem171Q4KL18 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem171Q4KL18 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms