Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc3lQ4KL14 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc3lQ4KL14 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms