Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms