Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx25Q3ZT31 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 730 ms