Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bbof1Q3V079 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bbof1Q3V079 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms