Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slfn4Q3UV66 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slfn4Q3UV66 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms