Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Chpf2Q3UU43 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms