Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ8

Cdkl5, Cyclin-dependent kinase-like 5, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl5Q3UTQ8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdkl5Q3UTQ8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdkl5Q3UTQ8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdkl5Q3UTQ8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkl5Q3UTQ8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms