Protein–RNA interactions for Protein: Q3USY0

Slc38a11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a11Q3USY0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc38a11Q3USY0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc38a11Q3USY0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc38a11Q3USY0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc38a11Q3USY0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc38a11Q3USY0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc38a11Q3USY0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc38a11Q3USY0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc38a11Q3USY0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc38a11Q3USY0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms