Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm28047Q3US59 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms