Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrch2Q3UMG5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms