Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpr55Q3UJF0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpr55Q3UJF0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms