Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx27Q3UHD6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms